지병이 있는 상태에서 임신을 했을 경우 기형아를 낳게 될 확률이 정상 임신부보다 높다. 그 대표적 예가 당뇨병이다. 임신부가 당뇨병에 걸리면 기형아 출산 비율이 일반 산모의 3배에 이르며, 무뇌아, 선천성 심장병, 고관절 탈구, 언청이, 6손 등의 기형 발생 빈도가 높다.
그밖에도 임질, 매독 등의 성병이나 에이즈에 걸려 있으면 태아에게 선천성심장병, 정신박약, 에이즈증후군을 유발시킨다.
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